Reference alignment for KilA-N domain proteins (PSI-BLAST)
Jump to navigation
Jump to search
Output alignment generated with PSI-BLAST. The last five sequences are missing since these were only partial matches.
Alignment generated with PSI-BLAST MBP1_SACCE SIMKRKKDDWVNATHIL----KA------A----------NFA--------KAKRTR------I-LEKEV-LKET--H-E--------------K-VQGG----FG------------K--YQ---G-TWVPLNIAKQLAEK--F--SVY-D-QLK-PLF--DFT-QTDG MBP1_YARLI AVMRRKSDGWVNATHIL----KV------A----------GFD--------KPQRTR------I-LEKEV-QKGV--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TWVPLERAREIATL--Y--DVD-S-HLA-PIF--NYD-DEDG 5821_NEUCR -VMRRRHDDWVNATHIL----KA------A----------GFD--------KPARTR------I-LEREV-QKDT--H-E--------------K-IQGG----YG------------R--YQ---G-TWIPLEQAEALARR--N--NIY-E-RLK-PIF--EFQ-PGN- 9090_CRYNE AVMRRRSDAYLNATQIL----KV------A----------GFD--------KPQRTR------V-LEREV-QKGE--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TWIPIERGLALAKQ--Y--GVE-D-ILR-PII--DYV-PT-- MBP1_ASPNI SVMRRRSDDWINATHIL----KV------A----------GFD--------KPARTR------I-LEREV-QKGV--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TWIPLQEGRQLAER--N--NIL-D-KLL-PIF--DYV-AGD- MBP1_KLULA SIMKRKADNWVNATHIL----KA------A----------KFP--------KAKRTR------I-LEKEV-ITDT--H-E--------------K-VQGG----FG------------K--YQ---G-TWIPLELASKLAEK--F--EVL-D-ELK-PLF--DFT-QQEG MBP1_GIBZE AVMRRRNDSWLNATQIL----KV------A----------GVD--------KGKRTK------I-LEKEI-QTGE--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TWIKFERGLQVCRQ--Y--GVE-E-LLR-PLL--TYDMGQDG MBP1_ASPTE SVMRRRADDWINATHIL----KV------A----------GFD--------KPARTR------I-LEREV-QKGV--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TWIPLPEGRLLAER--N--NII-D-KLR-PIF--DYV-AGD- MBP1_CANAL -IMRRKKDSWINATHIL----KI------A----------KFP--------KAKRTR------I-LEKDV-QTGI--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TYVPLDLGAAIARN--F--GVY-D-VLK-PIF--EFQ-YIEG MBP1_CANGL SIMKRKNDGWVNATHIL----KA------A----------NFA--------KAKRTR------I-LEKEV-LKEM--H-E--------------K-VQGG----FG------------K--YQ---G-TWVPLNIAINLAEK--F--DVY-Q-DLK-PLF--DFS-EENG 1770_YARLI AVMRRRTDSSLNATQIL----KV------A----------GVE--------KSKRTK------I-LEKEI-LTGA--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TWIPYERGVDLCRQ--Y--SVY-D-VLQ-PLL--AFD-P--- 2974_MAGGR -VMRRRVDDWINATHIL----KA------A----------GFD--------KPARTR------I-LEREV-QKDQ--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TWIPLEAGEALAHR--N--NIF-D-RLR-PIF--EFS----- 1485_USTMA AVMRRRGDGWLNATQIL----KI------A----------GIE--------KTRRTK------I-LEKSI-LTGE--H-E--------------K-IQGG----YG------------K--FQ---G-TWIPLQRAQQVAAE--Y--NVS-H-LLQ-PIL--EFD-P--- MBP1_USTMA AVMRRRSDDWLNATQIL----KV------V----------GLD--------KPQRTR------V-LEREI-QKGI--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TWIPLDVAIELAER--Y--NIQ-G-LLQ-PIT--SYV-PS-- 0560_GIBZE -VMRRRSDDWINATHIL----KA------A----------GFD--------KPARTR------I-LERDV-QKDV--H-E--------------K-IQGG----YG------------K--YQ---G-TWIPLESGQALAER--H--SVI-D-RLR-PIF--EYV-QG-- 4232_ASPFU --MRRRGDDWINATHIL----KV------A----------GFD--------KPARTR------I-LEREV-QKGT--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TWIPLHEGRLLAER--N--NII-D-KLR-PIF--DYV-AGD- MBP1_CRYNE SVMRRASDSWVNATQIL----KV------A----------GVH--------KSARTK------I-LEKEV-LNGI--H-E--------------K-IQGG----YG------------K--YQ---G-TWVPLDRGRDLAEQ--Y--GVG-S-YLS-SVF--DFV-PS-- MBP1_NEUCR AVMRRQKDGWVNATQIL----KV------A----------NID--------KGRRTK------I-LEKEI-QIGE--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TWIPFERGLEVCRQ--Y--GVE-E-LLS-KLL--THNRGQEG MBP1_DEBHA -IMRRKLDSWINATHIL----KI------A----------KFP--------KAKRTR------I-LEKDV-QTGV--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TYVPLDLGADIAKN--F--GVF-D-SLR-PIF--EFT-YVEG 2876_CANAL SIMRRCKDDWVNATQIL----KC------C----------NFP--------KAKRTK------I-LEKGV-QQGL--H-E--------------K-VQGG----FG------------R--FQ---G-TWIPLEDARRLAKT--Y--GVT-E-ELA-PVL--FLD-FSD- MBP1_MAGGR AVMKRIGDSKLNATQIL----KV------A----------GVE--------KGKRTK------I-LEKEI-QTGE--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TWIKYERALEVCRQ--Y--GVE-E-LLR-PLL--EYN----- 4319_ASPNI AVMKRRSDGWLNATQIL----KV------A----------GVV--------KARRTK------T-LEKEI-AAGE--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TWVNYQRGVELCRE--Y--HVE-E-LLR-PLL--EYD----- MBP1_ASPFU AVMKRRSDSWLNATQIL----KV------A----------GVV--------KARRTK------T-LEKEI-AAGE--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TWVNYQRGVELCRE--Y--HVE-E-LLR-PLL--EYD----- MBP1_SCHPO SVMRRRRDSWLNATQIL----KV------A----------DFD--------KPQRTR------V-LERQV-QIGA--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TWVPFQRGVDLATK--Y--KVD-G-IMS-PIL--SLD-IDEG 5548_ASPTE AVMKRRSDSWLNATQIL----KV------A----------GVV--------KARRTK------T-LEKEI-AAGE--H-E--------------K-VQGG----YG------------K--YQ---G-TWVNYQRGVDLCRE--Y--HVE-E-LLR-PLL--EYD----- 5496_SCHPO -LMKRCHDNWLNATQIL----KI------A----------ELD--------KPRRTR------I-LEKFA-QKGL--H-E--------------K-IQGG----CG------------K--YQ---G-TWVPSERAVELAHE--Y--NVF-D-LIQ-PLI--EYS-GS-- 7246_DEBHA -IMRRCKDDWVNATQIL----KC------C----------NFP--------KAKRTK------I-LEKGV-QQGL--H-E--------------K-IQGG----YG------------R--FQ---G-TWIPLADAQRLAAS--Y--GVT-P-DLA-PVL--YLD-ASD- MBP1_EREGO SIMKRKADDWVNATHIL----KA------A----------KFA--------KAKRTR------I-LEKEV-IKDT--H-E--------------K-VQGG----FG------------K--YQ---G-TWVPLDIARRLAQK--F--EVL-E-ELR-PLF--DFT-RRDG 6370_EREGO -VMRRLHDDWVNITQVF----KV------A----------TFS--------KTQRTK------I-LEKES-ADIS--H-E--------------K-IQGG----YG------------R--FQ---G-TWIPLDSAKGLVAK--Y--EIT-D-IVVLTVI--NFQ-PD-- SWI4_SACCE -VMRRTKDDWINITQVF----KI------A----------QFS--------KTKRTK------I-LEKES-NDMQ--H-E--------------K-VQGG----YG------------R--FQ---G-TWIPLDSAKFLVNK--Y--EII-DPVVN-SIL--TFQ-FD-- 4890_KLULA -IMRRCNDNWLNITQVF----KA------G----------SFT--------KAQRTK------I-LEKEA-NEIK--H-E--------------K-IQGG----YG------------R--FQ---G-TWIPWESTKYLVEK--Y--NIN-NKVVK-RIV--EFI-PD-- 4966_CANGL -VMRRTMDDWVNVTQVF----KI------A----------QFS--------KTQRTK------I-LEKES-TNMK--H-E--------------K-VQGG----YG------------R--FQ---G-TWVPLEAAKFMTTK--Y--NIDNP-VVN-TIL--SF------ 9785_DEBHA SVVRRADNNMINGTKLL----NV------A----------QMT--------RGRRDG------I-LKSEK-VRHV---------------------VKIG----SM------------H--LK---G-VWIPFERALAMAQR--E--GIV-D-LLY-PLF---------- 3009_ASPNI TVMWDYNIGLVRTTHLF----KC------N----------DYS--------KTTPAK------M-LNQNPGLRDI--C-H--------------S-ITGG----AL------------A--AQ---G-YWMPYEAAKAIAAT--FCWKIR-F-ALT-PLFGDNFP-D--- SOK2_SACCE SVVRRADNDMVNGTKLL----NV------T----------KMT--------RGRRDG------I-LKAEK-IRHV---------------------VKIG----SM------------H--LK---G-VWIPFERALAIAQR--E--KIA-D-YLY-PLF---------- 9680_CANGL TVVRRADNDMVNGTKLL----NV------T----------GMT--------RGRRDG------I-LKNEP-VRDV---------------------VKGG----PM------------T--LK---G-VWIPIDRARAIARQ--E--GIE-Q-WLY-PLF---------- 3001_EREGO SVVRRADNDMINGTKLL----NV------A----------KMT--------RGRRDG------I-LKAEK-VRHV---------------------VKIG----SM------------H--LK---G-VWIPFERALALAQR--E--KIV-D-MLF-PLF---------- 4197_CANAL SVVRRADNNMINGTKLL----NV------A----------QMT--------RGRRDG------I-LKSEK-VRHV---------------------VKIG----SM------------H--LK---G-VWIPFERALAMAQR--E--QIV-D-MLY-PLF---------- 4237_CANAL SVVRRADNNMINGTKLL----NV------A----------QMT--------RGRRDG------I-LKSEK-VRHV---------------------VKIG----SM------------H--LK---G-VWIPFERALAMAQR--E--QIV-D-MLY-PLF---------- 8256_ASPTE -VARREDNSMINGTKLL----NV------A----------GMT--------RGRRDG------I-LKSEK-IRHV---------------------VKIG----PM------------H--LK---G-VWIPFERALEFANK--E--KIT-D-LLY-PLF---------- 3440_ASPNI -VARREDNGMINGTKLL----NV------A----------GMT--------RGRRDG------I-LKSEK-VRNV---------------------VKIG----PM------------H--LK---G-VWIPFDRALEFANK--E--KIT-D-LLY-PLF---------- 2292_YARLI -VARREDNDMINGTKLL----NV------A----------GMT--------RGRRDG------I-LKGEK-LRHV---------------------VKAG----AM------------H--LK---G-VWIPYDRALEFANK--E--KII-D-LLF-PLF---------- 1102_YARLI -VARREDNNMINGTKLL----NV------V----------GMT--------RGRRDG------I-LKTEK-IRHV---------------------VKIG----AM------------H--LK---G-VWIPYERALAFAQR--E--RIV-D-VLY-PLF---------- 5125_ASPFU -VARREDNHMINGTKLL----NV------A----------GMT--------RGRRDG------I-LKSEK-VRHV---------------------VKIG----PM------------H--LK---G-VWIPFERALEFANK--E--KIT-D-LLY-PLF---------- PHD1_SACCE SVVRRADNNMINGTKLL----NV------T----------KMT--------RGRRDG------I-LRSEK-VREV---------------------VKIG----SM------------H--LK---G-VWIPFERAYILAQR--E--QIL-D-HLY-PLF---------- 8847_CANGL SVVRRADNDMINGTKLL----NV------T----------KMT--------RGKRDG------I-LRSEK-YRKV---------------------VKIG----SM------------H--LK---G-VWIPFERALFIAKR--E--KIV-D-LLY-PLF---------- 5499_YARLI -IIWDYHTGYVHLTGLW----KA------I----------GNS--------KADIVK------L-IDNSPDLEAV--I-R--------------R-VRGG----YL------------K--IQ---G-TWVPYDIARALASRTCY--FIR-F-ALI-PLFGQDFP-GT-- 5299_KLULA SVVRRADNDMINGTKLL----NV------T----------RMT--------RGRRDG------I-LKAEK-IRHV---------------------VKIG----SM------------H--LK---G-VWIPFERALVMAQR--E--KIV-D-LLY-ALF---------- 0305_GIBZE -VARREDNHMINGTKLL----NV------A----------GMT--------RGRRDG------I-LKSEK-VRHV---------------------VKIG----PM------------H--LK---G-VWIPYDRALDFANK--E--KIT-E-LLY-PLF---------- 0837_NEUCR -VARREDNAMINGTKLL----NV------A----------GMT--------RGRRDG------I-LKSEK-VRHV---------------------VKIG----PM------------H--LK---G-VWIPFERALDFANK--E--KIT-E-LLY-PLF---------- 8552_MAGGR -VARREDNHMINGTKLL----NV------A----------GMT--------RGRRDG------I-LKSEK-MRHV---------------------VKIG----PM------------H--LK---G-VWIPFERALDFANK--E--KIT-E-LLY-PLF---------- 0447_DEBHA -VSRREDTNYVNGTKLL----NV------A----------GMT--------RGKRDG------I-LKTEK-TKSV---------------------VKVG----AM------------N--LK---G-VWIPFERASEIARN--E--GID-G-LLY-PLF---------- 9978_GIBZE AVMWDYNIGLVRMTPFF----KC------R----------GYG--------KTIPAK------M-LGLNPGLKEI--T-H--------------S-ITGG----SI------------A--AQ---G-YWMPYRCAKAICAT--FCHPIA-G-ALI-PIF---------- 1513_CANAL -VSRREDTNYINGTKLL----NV------I----------GMT--------RGKRDG------I-LKTEK-IKNV---------------------VKVG----SM------------N--LK---G-VWIPFDRAYEIARN--E--GVD-S-LLY-PLF---------- 6132_SCHPO --LRRCPDSYFNISQIL----RL------A----------GTS--------SSENAK------E-LDDII-ESGD--Y-E--------------N-VDSK----HP------------Q--ID---G-VWVPYDRAISIAKR--Y--GVY-E-ILQ-PLI--SFN----- 1244_ASPFU -VMWDYNIGLVRTTHLF----KC------N----------DYS--------K-----------M-LNANPGLREI--C-H--------------S-ITGG----AL------------A--AQ---G-YWMPYEAAKAVAAT--FCWKIR-H-ALT-PLFGLDFP-S--- 0925_USTMA TMMIDVDTSFVRFTSIT----QA------L----------GKN--------KVNFGR------L-VKTCP-ALDP--HIT--------------K-LKGG----YL------------S--IQ---G-TWLPFDLAKELSRRIAW--EIR-D-HLV-PLFGYDFP-ST-- 2599_ASPTE -IMWDYNIGLVRTTPLF----RS------Q----------NYS--------KTTPAK------V-LDANPGLREI--S-H--------------S-ITGG----AI------------V--AQDKPG-YWIPFEAAKAVAAT--FCWRIR-Y-ALT-PIFGLDFP-SQ-- 9773_DEBHA -IIWDYETGFVHLTGIW----KA------S----------INDEVNTHRNLKADIVK------L-LESTPKQYHQ--H-I--------------KRIRGG----FL------------K--IQ---G-TWLPFDLCKMLAKRFCY--HIR-F-QLI-PIF---------- 0918_CANAL -VIWDYETGWVHLTGIW----KA------SLTIDGSNVSPSHL--------KADIVK------L-LESTP-KEYQ--Q-YIK------------R-IRGG----FL------------K--IQ---G-TWLPYKLCKILARRFCY--YLR-Y-SLI-PIFGTDFP-DS-- 9901_DEBHA -ILRRVQDSYINISQLFSILLKI------G----------HLS--------EAQLTN------F-LNNEI-LTNT--Q-Y--------------L-SSGG----SNPQFNDLRNHEVRD--LR---G-LWIPYDRAVSLALK--F--DIY-E-LAK-SLF---------- 7766_ASPNI -LMRRSKDGYVSATGMF----KI------A-----------FP--------WAKLEEERSEREY-LKTRP-ETSE--D-E----------------IAGN----------------------------VWISPVLALELAAE--Y--KMY-D-WVR-ALL--D------- 5459_GIBZE -LMRRSYDGFVSATGMF----KASFPYAEA----------SDE--------DAERKY------I---KSL-PTTS--H-E--------------E-TAGN----------------------------VWIPPEQALILAEE--Y--KIS-P-WIR-ALL--DPT-P--- 2267_NEUCR -LMRRSQDGYISATGMF----KA------TFPYASQ----EEE--------EAERKY------I---KSI-PTTS--S-E--------------E-TAGN----------------------------VWIPPEQALILAEE--Y--QIT-P-WIR-ALL--D---PSD- 3510_ASPFU -LMRRSKDGYVSATGMF----KI------A-----------FP--------WAK-----------LEEEK-AERE--Y-L--------------K-TREG----TS------------EDEIA---GNIWVSPLLALELAKE--Y--QMY-D-WVR-ALL--D------- 3762_MAGGR -LMRRSSDGYVSATGMF----KATFPYADA----------EDE--------EAERNY------I---KSL-PATS--K-E--------------E-TAGN----------------------------VWISPDQALALAEE--Y--SIA-T-WIR-ALL--D---PTD- 3412_CANAL -VLRRVQDSFVNVTQLF----QI------LIKLE------VLP--------TSQVDN------Y-FDNEI-LSNL--K-YFGSSSNTPQYLDLRK-HQNI----Y----------------LQ---G-IWIPYDKAVNLALK--F--DIY-E-ITK-KLF---------- 6166_SCHPO -LMRMAKDSSISATSMF----RS------A-----------FP--------KATQEE------EDLEMRW-IRDN--L-N--------------P-IEDK------------------R--VA---G-LWVPPADALALAKD--Y--SMT-P-FIN-ALL--EAS-ST-- XBP1_SACCE FLM----DGYVSATGMF----KI------A-----------FP--------WAKLDEERSEREY-LKSRE-ETSE--D-E----------------IAGN----------------------------VWISPKLALELAGE--Y--QMY-N-WVR-ALL--D---PTD-
